Explikation

2004-02-29

Fiskforskare hjälpte till med Hitta Nemo

Adam Summers, expert på fiskarnas biomekanik, blev engagerad av Pixar för att hjälpa dem med filmen Hitta Nemo. Han fick under tre år föreläsa om hur fiskar rör sig och ser ut. Hans kollegor gratulerar honom men har ofta hittat något de tycker är fel ändå. Egentligen borde Nemos pappa bytt kön när mamman blev uppäten och hajarna har ju inga parningsorgan.

Filmen om Nemo blundar för snoppar och könsbyten

2004-02-27

Prata på

Senaste numret av Science är ett temanummer om språkets utveckling och historia. Mycket läsvärt, många olika infallsvinklar och vetenskapsområden tas upp. Bland annat behandlar en artikel utvecklingen av programmeringsspråk, en parallell som inte alltid kommer fram i de här sammanhangen.

Robot som drivs med muskelkraft

Forskare i Los Angeles har byggt en robot, hälften så stor som bredden på ett hårstrå, som drivs med levande hjärtmuskelceller. Man föreslår att den här tekniken skall kunna användas för att t.ex. hjälpa förlamade att andas och att horder av "musclebots" kan reparera små hål i rymdskepp

Artikel
Från http://www.newscientist.com

2004-02-26

Ingen smitta längre i Stockholm

Regeringen meddelade idag att EU:s nya smittskyddsmyndighet kommer att placeras i Stockholm. I december togs beslutet att det var Sverige som skulle bli ansvarigt för att sjukdomar stoppas i tid inom EU, och nu är det alltså klart i vilken stad myndigheten hamnar.

Pressmeddelandet läses här.

Snabb evolution

Forskare från Texas förstörde bakteriers möjlighet att göra disulfidbindningar, något som är nödvändigt bl.a. för bakteriernas framdrivningsmaskineri (ungefär som en propeller). Bakterierna som inte kunde röra sig muterades slumpmässig och lades i näringslösning. När de ätit upp allt i närheten så var de ju tvugna att flytta på sig för att hitta mer mat. Det visade sig att några mutanter kunde använda ett protein där endast två aminosyror var förändrade för att på nytt göra disulfidbindningar . Dessa kunde då röra sig och leta mat.

Det är ett helt nytt sätt att göra bindingarna som bakterierna använder sig av och kan vara viktigt för t.ex. sjukdomsförståelse



"The naturally occurring enzymes involved in disulfide bond formation are a biological pathway whose main features are the same from bacteria to man," Bardwell said. "Understanding how disulfide bond formation occurs and figuring out new ways to make it happen could be important to numerous disease states, like Alzheimer's and cystic fibrosis, that result from defective protein folding. "


Celeras data släpps fritt

Celeras version av det mänskliga genomet släpps nu fritt. Celera och HUGOprojektet presenterade sina resultat samtidigt men Celeras har man hittills varit tvungen att betala för att få tillgång till. De två versionerna kompletterar varandra, Celeras är mer exakt vad det gäller ordning medan HUGOprojektet är mer exakt på repetitiva DNA-sekvenser.

2004-02-25

Genetiskt modifierade farhågor

Att genetiskt modifiera en organism är en teknik som används till exempel inom livsmedelsindustrin för att ge billigare eller bättre produktion. Men sedan tekniken utvecklades har det funnits farhågor om vad som skulle kunna hända om de genetiskt modifierade stammarna började blanda sig med de normala.

Howard, DeWoody och Muir från Purdue University i USA har blandat en population medakafisk, en liten japansk firre som passar bra för genetisk forskning då den förökar sig snabbt, med en variant som har fått en tillväxthormon-gen från lax. De modifierade hanarna hindrade de omodifierade att para sig med honorna, vilket gjorde att den modifierade andelen av populationen snabbt växte. Men överlevnaden var mycket lägre bland avkomman till de genetiskt modifierade, hela populationen fick alltså lägre livsduglighet.

Författarna hävdar att detta leder till undergång för populationen, trots att fiskarna från början var större och starkare. Artikeln kan läsas i PNAS, enklast genom den här länken.

2004-02-24

Pentagon - Klimatförändringarna förstör världen

Guardian säger sig ha tillgång till en hemlig rapport från Pentagon. I rapporten beskrivs hur kraftiga klimatförändringar leder till konflikter om mat och vatten och kärnvapenkapprustning.

'Disruption and conflict will be endemic features of life,' concludes the Pentagon analysis. 'Once again, warfare would define human life.'

Vi skrev tidigare om hur Bush kritiseras för att strunta i forskningsrapporter som inte passar in i policyn.
The findings will prove humiliating to the Bush administration, which has repeatedly denied that climate change even exists.

NASAs favoritlåtar

Det har blivit något av en tradition för NASA att spela en låt varje ny dag under ett rymdprojekt.

"The function of the Wake-Up Music is as it would suggest, to 'wake-up' the mission team and get them focused on the days activities."

Här finns låtarna som spelas för Spirit på Mars. Vad sägs om:

Hail to the Chief, by the Mormon Tabernacle Choir. (Presidenten ringer.)
Satisfaction, by the Rolling Stones. ("I can't get no ...", Luftkuddarna funkade inte.)
Flash, by Queen. (Flashminnet krånglar)

2004-02-23

Oroande ökning av HIV-smitta

Det är inte bara i Sverige som antalet nyupptäckta fall av HIV-smitta ökade förra året, även i England och Wales ser man samma trend enligt British Medical Journal. Där ökade antalet med runt 20% under 2003 jämfört med 2002.

Den främsta smittovägen är oskyddat samlag. Dr Barry Evans vid Health Protection Agency, Storbritanniens motsvarighet till Smittskyddsinstitutet, tror att människor på många sätt har vant sig vid att HIV existerar och därför inte är lika försiktiga. Skrämselpropagandan från 80-talet fungerar inte längre.

Läs mer i BMJ.

Jättestort teleskop (ca en miljon kilometer brett)

Forskare som vill ta sig en närmre titt på svarta hål skall använda sig av ett jättelikt naturligt teleskop där ett stort gasmoln bildar linsen. Funkar det så kommer det att vara 10000 gånger bättre än Hubble. Artikeln .

2004-02-20

Bush förvanskar vetenskapen

60 amerikanska forskare (inlusive 20 nobelpristagare) från Union of Concerned Scientists har skrivit en rapport om hur Bush-administrationen hanterar forskning. De kritiserar Bush för att förvränga forskningen genom att dölja resultat som går emot regeringens åsikter, tillsätta viktiga poster med underkvalificerade ja-sägare som har stark koppling till industrin och lägga ner vissa kommitteer. Det handlar om områden som miljöforskning (klimatförändringar), kärnvapenforskning, arbetsmiljö och hälsa.


We found a serious pattern of undermining science by the Bush administration, and it crosses disciplines, whether it's global climate change or reproductive health or mercury in the food chain or forestry -- the list goes on and on," said Kevin Knobloch, president of the Union of Concerned Scientists.


Artiklar i Wired och CNN

10 Gig extra minne till min hjärna tack.

Forskare i Calgary har lyckats få nervceller som växer på ett microchip att "lära" sig saker. Nervceller fästes på kiselchip och stimulerades att kommunicera med varandra. Kopplingarna mellan nervceller förändrades och dessa förändringar kunde avläsas.

2004-02-19

Svart hål sliter sönder stjärna

NASA rapporterar att de haft första parkett vid när ett svart hål slet sönder en stjärna och också slukade en del av den. Det hela sågs av röntgenobservatoriet Chandra som ligger i omloppsbana runt jorden.

"This unlucky star just wandered into the wrong neighborhood."


[uppdatering]
För den som vill ha en artikel på svenska (och coola bilder) så har nu DN skrivit om det.

Britterna fördelar sina tillgångar

Ett nytt system för att fördela de statliga forskningsanslagen verkar vara på gång i Storbritannien. Tidigare rankades varje avdelning enligt en sjupoängskala. Enligt det nya systemet ska istället varje publikation (bok, artikel eller annat) rankas och andelen med hög rang ska ligga till grund för hur mycket pengar som delas ut. Kan detta vara något för herr Östros att fundera på?

Nature står för informationen.

Nya rymdäventyr

Uppskjutningstidpunkten för Rosetta, den europeiska kometjagaren, har slutgiltigt fastställts. Det kommer att ske på fredag den 26:e klockan 8:36 (svensk tid). Vi får hoppas att inget exploderar den här gången.

Rosetta är det första projektet för att inspektera en komet på nära håll. Den ska både cirkulera runt och landa på kometen Churyumov-Gerasimenko, och förhoppningsvis ge oss ny information om hur vårt solsystem bildades. Men håll inte andan i väntan på resultaten, Rosetta beräknas inte komma fram till sitt mål förrän 2014.

ESA:s Rosetta-hemsida finns här.

2004-02-18

Catfight

Kvinnor fäller mer sarkastiska kommentarer om varandra när de är i den fertila fasen av menstruationscykeln. Det hävdar i alla fall Maryanne Fisher i York University, Kanada. Hon har visat bilder av personer och låtit kvinnor och män skatta utseendet på dem. De fertila kvinnorna tenderade att anse att andra kvinnor såg sämre ut än vad de kvinnor som inte var i fertil fas ansåg, däremot var det ingen skillnad mellan vad de tyckte om bilderna på olika män.

Fisher anser att detta visar att nedsättande beteende mot andra kvinnor ger en fördel i jakten på en man. Själv undrar jag hur man utnyttjar denna information till egen fördel?

Läs mer på Natures nyhetssida.

Cellstyrning

Genteknik, stamceller och omega-fetter. Alla skulle de göra oss friskare, gladare och låta oss leva längre, alla fick de miljoner och åter miljoner i forskningsanslag.

Men glöm allt det. Det senaste och häftigaste inom biotekniken är RNA-inhibition, RNAi. Man hoppas att det ska kunna bli ett sätt att styra generna i en cell utifrån, att få cellen att producera eller sluta producera ett speciellt protein på kommando. Det ska gå till genom att använda short interfering RNA, förkortat siRNA, vilket är små bitar av RNA som kan konstrueras för att kontrollera genuttrycket i en cell. Kanske man kan använda siRNA mot till exempel cancerceller för att hindra dem från att delas, eller mot HIV för att hålla det borta från lymfocyterna. Kanske.

Man kan läsa mer exempelvis på Nature Reviews sida om RNAi (med en häftig animation).

2004-02-17

Mars nästa för människan?

Samtidigt som DN påminner oss om Mars i litteraturen så tar
Gustav upp bråket om Hubble, att många nu misstänker att man skall lägga ner Hubble, inte för att det är vetenskapligt motiverat utan för att få pengar till att åka till Mars. [Nature, prenumeration behövs]


Superflugan - kan den berätta om vi blir marsianer?

Vetenskapens värld hade igår ett program om bananflugan och dess betydelse för forskningen.

Det har snart gått hundra år sedan amerikanen Thomas Hunt Morgan kom på att just den här insekten var idealisk för att studera evolutionen. Han samlade ihop så mycket flugor han kunde hitta och snart var hans laboratorium ett illaluktande kaos med övermogen frukt och flugburkar överallt.


NASA tänker nu skicka upp flugorna i rymden, Drosophila Behavior and Gene Expression in Microgravity, för att studera hur rymdfärder påverkar genuttrycket.

One day many generations of people, too, will live in space. If genetic changes accumulate from generation to generation--an unknown of space travel--settlers on the Moon or Mars might diverge genetically from their Earth relatives. Living on Mars really would turn you into a Martian. Fruit flies could give us a preview of that process (if it exists).


[Uppdatering]
Såg just att Spinster and spin(n)ster uppskattar Explikation och också nämner bananflugerprogrammet. Vilket sammanträffande.

2004-02-16

Tillbaka till klonerna

Artikeln som beskriver hur det sydkoreanska forskarlaget gjorde för att klona mänskliga embryonala stamceller är tyvärr fortfarande oåtkomligt för mig (Linköpings universitet har inte rätt slags prenumeration på Science för att jag ska kunna läsa den) men lite mer information har kommit ut de senaste dagarna i diverse nyhetsartiklar.

Forskarna använde totalt 242 ägg för proceduren, men även i den mest effektiva behandlingen de testade var det endast 19 av 66 ägg som utvecklades till embryon. Och av de embryo som bildades var det bara 1 av 20 som de lyckades få levnadsdugliga stamceller från (från icke-klonade embryon brukar man kunna ta stamceller från ungefär hälften).

De har inte heller helt övertygande visat att cellerna som skapades faktiskt är klonade. Det finns fortfarande en (liten) möjlighet att det är äggets egen arvsmassa i stamcellerna, men man har använt ett test av vilka gener som uttrycks i cellen för att visa att de troligtvis är klonade. I klonade stamceller är både faderns och moderns gener aktiva, vilket de inte alltid är annars. Stamcellerna som producerades visar samma mönster som klonade celler, men det är inte definitivt avgjort än.

Om du vill veta mer så har Science en nyhetsartikel i senaste numret.

Lär bakterier nya språk

Roland Piquepaille's Technology Trends och Hakank skriver om en ny cool tillämpning av bakterier, lär dem att använda nya kemikalier för att prata med varandra.

Bakterier använder signalsubstanser för att kommunicera, forskarna har lyckas få dem att använda nya signalsubstanser. Då är det lättare att styra dem till att t.ex. börja producera en kemikalie vid önskat tillfälle och plats. Kombinerat med att vi kan lära dem att tillverka kemikalier som dödar andra (sjukdomsalstrande) bakterier så kan vi kanske bekämpa sjukdomar på ett helt nytt sätt.

Nature, Talking to bacteria.

2004-02-12

Det kunde vara värre

Det är torsdag, vilket betyder nytt nummer av Nature.

I en artikel berättas det om att klimatforskaren Bill Ruddiman har lagt fram en teori om att människan har påverkat jordens klimat under mycket längre tid än man tidigare har trott. För 8,000 år sedan började människan hugga ner träd för att skapa åkermarker, och för 5,000 år sedan började man i Asien med att skapa översvämmade åkrar för att odla ris. Detta medförde att koldioxid och metan släpptes ut i atmosfären i allt större utsträckning, och på våra nordliga breddgrader kan det ha höjt årsmedeltemperaturen med uppemot 2 grader.

Men som alltid i den vetenskapliga världen finns det kritiker. Vissa hävdar att utsläppen av metan och koldioxid inte på långa vägar kan ha varit tillräckliga för att orsaka temperaturhöjningen. Läs mer om debatten i den här artikeln.

Klonerna anfaller

Enligt divese nyhetssidor har ett koreanskt forskarlag lyckats utföra en så kallad terapeutisk kloning av mänskliga celler, det vill säga att embryoceller har fått en vuxen människas arvsmassa och sedan använts till att ersätta skadad vävnad eller organ.

En av de sidor som hävdar detta är New Scientist, tyvärr verkar inte artikeln som de hänvisar till (från Science) vara tillgänglig för närvarande, så Explikation får nog anledning att återvända till ämnet.

Sover vi för mycket?

Enligt en kort artikel i Sleep [PDF] så kan det vara dåligt för hälsan att sova åtta timmar per natt. Mortaliteten ökade bland folk som sov mer än 7.5 timmar per natt. Å andra sidan verkar barn må sämre av mindre sömn (Nähä! ;)

Från Ars Technicas Science Sunday

2004-02-11

Kristofer bloggar länkar

Jag har gjort om min hemsida och testar nu att blogga alla länkar man hittar. Det handlar mest om biologiska beräkningar och bioinformatik. Artiklar, databaser, konferenser mm.

Använder Blosxom.

forskningens roliga sidor

Ibland behöver får man se till att ta lite mindre allvarligt på forskningen, Annals of Improbable Research (AIR) har en blog (det är även de som delar ut
The Ig Nobel Prize)

Den här seriestrippen kanske passar in på ämnet.

2004-02-10

Utställningen Unga Forskare

Det är dags för Utställningen Unga Forskare igen, UUF 2004. Gymnasielever kan ställa ut projekt de har gjort på Tekniska museet i Stockholm. Roligt, man får träffa forskarna i juryn och diskutera det man gjort med dem, man kan få stipendier (t.ex. en vecka på Weissmaninstitutet i Israel, ställa ut på Intel ISEF science fair i USA mm). Dessutom en massa aktiviteter runt omkring:

"Vill du t.ex. spana in labben på AstraZeneca eller leka med robotar på KTH? Vill du också träffa ett hundratal nya kompisar? Vill du höra allt om galna experiment av nästan lika galna forskare? Vill du få en skymt av Kronprinsessan Victoria? Vill du skrida runt på festliga middagar? Vill du dessutom söka mördare bland skrymslen och vrår på Kungl. Vetenskapsakademien?"

Ta en tur förbi och se utställningen!

Från FUF:s medlemssidor

Evolutionen skall fortsätta heta evolutionen i Georgia

Efter att ha fått mycket kritik så lägger man nu ner förslaget [cnn] att ta bort ordet "evolution" i skolorna och ersätta det med "biological changes over time.''

Underlig ide från början, att byta namn på något för att det inte skall vara så kontroversiellt. Det vetenskapliga konceptet är fortfarande detsamma.

2004-02-09

Firebird blir Firefox

Get Firefox Eftersom jag tidigare skrev om Mozilla Firebird så är det väl på sin plats att tala om att nya namnet är Mozilla Firefox och versionsnumret är 0.8

BBC kör en serie om hjärnan och sinnena, här kan man göra ett test för att se om man kan avslöja ett äkta eller falskt leende?

[uppdatering] Här är fler psykologiska test från BBC

Microarraybok online

För den som är intresserad av microarrayer så finns en finsk bok om "DNA Microarray Data Analysis" online

2004-02-06

Telefoner ofarliga (åtminstone tills vidare)

En dansk studie har undersökt sambandet mellan mobiltelefonanvändning och akustiskt neurom, vilket är den cancerform som mest troligt skulle utvecklas om mobilstrålningen är farlig. Hitills har det bara funnits en studie (svensk dessutom) som har visat ett samband däremellan, men den har kritiserats mycket för brister i upplägget.

Danskarna konstaterar att det inte finns något samband, åtminstone inte på ett tioårsperspektiv. Så vi som inte har använt mobiltelefon i fulla tio år än går numera säkra. Efter det vet vi fortfarande inget.

Artikeln hittas i American Journal of Epidemiology 2004; 159:277-283.

Snabbsök med Firebird



I Linux, Windows (och ibland även Mac) använder jag Mozilla Firebird som webläsare. (Internet Explorer kan inte på långa vägar mäta sig med Firebird. )
Biblioteksrelaterat tipsade om NeedleSearch ett sökfält till Firebird (även Mozilla och Netscape) där man själv kan kan lägga in sökmotorer. Funkar riktigt bra, nu är det bara att söka i Google, PubMed, CiteSeer eller svensk-engelska ordlistan utan att leta upp deras söksidor.

2004-02-05

Var med i Hjärnkontorets experiment

För er som vill uppmuntra ungdomens nyfikenhet på forskning eller själva är forskningsintresserade ungdomar (ivarjefall till själ och hjärta):



Direkt efter vårens första program den 10 februari 2004 klockan 19.00 prick, ber vi alla våra tittare att undvika använda el ända fram till 20.00! [...] Målet är att minska elkonsumtionen såpass mycket att den är synbar i regionala mätningar.

Hjärnkontoret är bra, anmäl er nu!

Fysiker försöker sig på framtidsforskning

Enligt Guardian så försöker fysiker använda matematiska modeller för att förutsäga vad som händer i samhället.

Unlikely as it might sound, there are signs that aspects of social behaviour follow mathematical laws akin to those obeyed by insensate matter in the physical sciences.

Den som läst Asimovs Stiftelseböcker lär väl tänka på psykohistoria.
Psychohistory was also the name of a fictional science in Isaac Asimov's Foundation Trilogy universe, which combined history, psychology and mathematical statistics to create a (nearly) exact science of the behavior of very large populations of people, such as the Galactic Empire. Asimov used the analogy of a gas - In a gas, the motion of a single molecule is very difficult to predict, but the mass action of the gas can be predicted to a high level of accuracy. Asimov applied this concept to the population of the fictional Galactic Empire, which numbered in the quadrillions. The character responsible for the science's creation, Hari Seldon, established two postulates: that the population whose behaviour was modeled should be sufficiently large and that they should remain in ignorance of the results of the application of psychohistorical analyses. [från Wikipedia]

Asimov gör en analogi med gaser, i Guardian lika så, Some traffic physicists argue that traffic exists in three distinct states: free flow, congested flow and jams. These are analogous to the gas, liquid and solid states of matter

2004-02-04

Gamla saker på nätet

För den som är intresserad av historisk forskning kan kanske The Aerial Reconnaissance Archives vara intressant. Det är en databas med flygfoton tagna över Europa under andra världskriget. Tyvärr var det lite större efterfrågan på detta än vad man hade räknat med, den sökbara katalogen blev totalt överbelastad de första dagarna den var tillgänglig och ligger för närvarande nere.

Och för den som mer allmänt är intresserad av historia kan jag tipsa om Peter Englunds hemsida. Han har lagt ut flera texter (bland annat från sina böcker) och berättar dessutom varje dag om en historisk händelse kopplat till dagens datum.

2004-02-03

Levande maskiner

Wired har en artikel om Living Machines. Hur vi från den kunskap vi har om levande organismer kan lära oss bygga maskiner med sådana egenskaper.

Mönsterbildning
Självorganisation.
Reproduktion
Evolution, anpassning.

Consider a hypothetical pod of Predator drones. Each unmanned aerial vehicle monitors terrain, weather, and potential threats, and continuously receives target updates and transmits its findings via satellite. The drones are motivated by two rules: hunger for valuable intelligence and repulsion from other drones to minimize redundant observation. These rules enable the UAVs to direct themselves better than any dispatcher could. Other rules help the fleet survive. When a drone observes a hostile signature - missile, rocket-propelled grenade, rifle fire - it executes an evasive maneuver from a stored repertoire. As Predators live and die by these rules, they generate new information about fitness under various conditions. Genetic algorithms use this data to breed more effective rules. Predators are connected, so if one is shot down over Afghanistan, all drones everywhere gain improved responses to that form of attack. This is precisely how bacteria develop resistance to antibiotics, only faster.

Hubble hittar planet med kol och syre

Rymdteleskopet Huhbble som var på väg att läggas ner har hittat en planet med kol och syre i atmosfären. Dock verkar atmosfären vara på väg att blåsa bort. Att den hand atmosfär visste man sedan tidigare.

2004-02-02

Science hade för ett tag sedan Breakthrough of the Year med
Illuminating the Dark Universe[prenumeration krävs] som vinnare. Men de skrev också om Areas to watch in 2004[prenumeration krävs] . Självklart nämner de forskningen på Mars men också Biodefense (försvar mot biologiska krigsmedel) och kvarkar. Dessutom, kommer open-access tidskrifter att funka? Och kommer man i USA att fortsätta öka säkerheten (göra det svårare?) [prenumeration krävs] att forska?

2004-02-01

Trafiken rullar igen på Mars

Japp, då verkar både Sprit och Opportunity vara igång [dn.se] [nasa.gov]. Såg på Vetenskapens världs program om robotarna. Blir imponerad av projektens storlek. Forskare och tekniker, experter inom de flesta områden man kan komma på, testa utrustning med helikoptrar och världens största vakumkammare... för att till slut köra en robot på en annan planet.

MERs hemsida finns här Kolla t.ex. instrumenten som de har med sig.


Cameras
• Panoramic Camera (Pancam)
• Microscopic Imager (MI)
See also the engineering cameras: Hazcams and Navcams


Spectrometers
• Miniature Thermal Emission Spectrometer (Mini-TES)
• Mössbauer Spectrometer (MB)
• Alpha Particle X-Ray Spectrometer (APXS)


Grinder
• Rock Abrasion Tool (RAT)

Magnets

• Magnet Array

The instruments use calibration targets, including a sundial, to determine accurate colors, brightnesses, and other information collected by the instruments.