Explikation

2004-05-31

Venus gör sitt bästa för att skymma solen nästa vecka

Nästa vecka kan du få se vad ingen nu levande människa någonsin sett: en Venuspassage. Venuspassagen infaller den 8 juni mellan 07.19 och 13.22, förra gången det inträffade var 1882. DN har en lång artikel om den historiska betydelsen av sådana här passager, astronomerna kunde t.ex. lära sig hur stort vårt solsystem är.

DN har också en instruktion om hur du gör om du vill titta på passagen. Som vanligt, titta aldrig rakt in i solen utan riktiga solfilter, även med solglasögon kan du bli blind. Man kan gå till Observatoriemuseet i Stockholm och titta, äta brunch och lyssna på föredrag.

European Southern Observatory har satt upp en webplats om venuspassagen.

2004-05-28

Dags att tänka på refrängen?

Den japanska forskaren Masataka Goto vid National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Tsukuba, har knåpat ihop en algoritm som ska kunna skilja mellan vers och refräng i musikstycken. Tanken är att CD-spelare ska kunna tillhandahålla funktionen att hoppa fram eller tillbaka till en viss del av musiken, man ska alltså slippa det tröstlösa spolandet där man ändå alltid missar det man vill höra.

Tyvärr verkar det bara vara ordentligt testat på Céline Dion och Bon Jovi. Men vi kan ju hoppas att det fungerar på njutningsbar musik också.


Källa: Nature.

Genpatent inte patent längre

Ett amerikanskt företag, Myriad Genetics, fick för tre år sedan patent på en gensekvens som man trodde låg bakom ärftlig bröst- och äggstockscancer.De har sedan krävt att alla sjukhus i Europa ska sluta göra egna bröstcancertest, och istället skicka testerna till Myriad Genetics lab i USA, något som är mycket dyrare. Men det skall inte behövas nu när patentet är upphävt i Europa.

Varför EPO, Europeiska patentverket, upphävde patentet verkar enligt vetenskapsradion vara för att man först patenterade fel gensekvens. NyTeknik nämner inte det utan skriver bara att det var p.g.a. bristande uppfinningshöjd, andra forskare hade också hittat genen. EPOs pressrelease blir jag inte klokare av. Myriad Genetics kan överklaga beslutet och det lär de väl göra men EPO har fattat ett vettigt beslut, stå fast vid det.

2004-05-27

Gamla nyheter

Det pratas på nyheterna idag en hel del om de svenska forskare som har upptäckt en viktig del i åldrandeprocessen. Artikeln, som är omslagsnyheten på dagens Nature, är skriven främst av forskare från Karolinska Institutet och den visar att möss åldras snabbare om de har en extra gen som skapar mutationer i deras mitokondriella DNA, mtDNA. Man har länge vetat att mutationer i just mtDNA är kopplat till åldrande, men ingen har tidigare kunnat visa att det är mutationerna som ger åldrandet och inte tvärt om.

Artikeln heter "Premature ageing in mice expressing defective mitochondrial DNA polymerase" och refereras som Nature 429:417-423.

2004-05-26

Rufsig i håret? Skyll på generna.

Forskare på Johns Hopkins University i USA har hittat en gen, kallad frizzled 6, som styr mönster i håret. OK, det kanske är svårt att skylla dagens frisyr på generna men hur virvlar och andra grundmönster i håret ser ut verkar styras av dem.

BBC
Resultaten publiceras i PNAS

2004-05-25

Konstruktionsmiss på de Gaulle?

Utredningen av vad som orsakade att en terminal kollapsade på Charles de Gaulle-flygplatsen i söndags kommer att fokuseras på att leta efter eventuella brister i den mycket ovanliga konstruktionen, skriver New Scientist. Eventuellt kommer samtliga terminaler rivas och byggas om.

Byggnadsingenjörer världen över kommer säkert att följa utredningen med spänning.

2004-05-24

Norge vill öka sin valjakt

Norge vill öka sin jakt på vikval eftersom valarna äter torsk. Det har höjts röster inom folketinget för att man kan döda tre gånger så många som nu utan att hota arten.

Men, som WWF säger, det är inte valarna som hotar torsken, det är ju människan. Att döda fler valar låter som en väldigt kortsiktig lösning.

2004-05-19

Grottmänniskor och gruvmänniskor

Flintasten var ett viktigt material för att framställa diverse verktyg innan Black & Decker uppfanns. Men för att hitta stenar av hög kvalitet räcker det inte alltid att leta där man står, eftersom den flinta som hittas på marken ofta är hårt åtgången av naturkrafterna. Gruvorna måste därför ha varit ett stort framsteg för mänskligheten. När man började gräva djupt i jorden kunde man hitta välbevarad sten som blev till bättre verktyg än vad som tidigare hade varit möjligt.

Några forskare, främst från Israel, har föreslagit en metod för att avgöra om flintasten ursprungligen togs från marken eller grävdes upp från mer än en meters djup. De använder en isotop av beryllium, Be-10, som bildas i stenarna av kosmisk strålning. Om stenen har spenderat det mesta av sin tid nedgrävd en bra bit under jordytan så har den inte heller utsatts för speciellt mycket kosmisk strålning och har därmed inte så mycket av Be-10. Resultatet av en sådan undersökning kan bli en ledtråd till hur gruvnäringen utvecklades.


Referens: PNAS 101(21):7880-7884.

Webbsajt för fattiga länders forskare

Läste i SIDAs tidning Omvärlden om scidev.net, the Science and development network som SIDA är med och finansierar.

Forskare i utvecklingsländer har dåliga förutsättningar. Vetenskapliga tidskrifter är för dyra och det är svårt att få egna resultat publicerade. SciDev.net försöker råda bot på problemen.

SciDev.net startades av David Dickson, före detta reporter på Nature. Nätverket, som stöds av Science och Nature beskriver sitt mål som att
enhance the provision of reliable and authoritative information on science- and technology-related issues that impact on the economic and social development of developing countries.

Hur många svenska forskare har samarbeten med forskare i u-länder? För mig verkar det som att det till största delen handlar om västeuropa och USA. Att samarbeta med u-länder kan nog ge en hel del nya perspektiv, som Omvärlden skriver:

På webbsajten finns inga artiklar om fetma eller utbrändhet. Däremot om ekologisk mångfald, malaria och föreorenat vatten.


En annan websajt med fokus på fattiga länders forskning är African Journals OnLine där man får tillgång till publicerad forskning från Afrika.

2004-05-18

Trackback

Explikation fortsätter att utvecklas, man kan skriva kommentarer och nu testar vi också Haloscans trackbackfunktion.

Ha en trevlig bloggardag.

DAMP-forskare polisanmälda

Tre personer i damp-forskaren Christopher Gillbergs grupp på Göteborgs universitet har blivit polisanmälda för att ha förstört forskningsmaterial.

Två personer, barnläkaren Leif Elinder och sociologen Eva Kärfve, har under de senaste bett att få granska Christopher Gillbergs forskningsmaterial om barn med damp. Gillberg har vägrat lämna ut materialet med hänvisning till ett löfte om sekretess till familjerna. Trots flera domar som gett de två forskarna rätt har det förblivit inlåst på Göteborgs universitet. Till slut så förstörde personer i Gillbergs grupp helt enkelt materialet istället för att lämna ut det. Kärfe menar att forskningen inte gått rätt till och säger i GöteborgsPosten:

- Damp är stendöd som diagnos. Det finns inte längre något vetenskapligt belägg eftersom allt bygger på Gillbergs forskning.

[uppdatering]
Chadie har redan kommenterat det här.

2004-05-17

Passivitetens pris

Här i Sverige har det redan beslutats om ett rökförbud på restauranger och pubar, men i Storbritannien debatteras frågan fortfarande. Professor Konrad Jamrozik vid Imperial College, London, presenterar på en konferens idag data som visar att varje vecka avlider en brittisk restaurangarbetare på grund av sin exponering för passiv rökning på arbetsplatsen. Detta kommer säkert att bli ett väl använt argument i debatten, även i Sverige.

Men tobaksindustrin och rökares intresseorganisationer är inte imponerade. "Var finns beviset för att passiv rökning dödar människor?", säger en talesman för organisationen Forest till New Scientist.


Konferensen i fråga anordnas av Royal College of Physicians.

DNA-skulptur... av kundvagnar.

Roland Pipquepaille uppmärksammar att engelska affärskedjan Somerfield låtit konstnären Abigail Fallis bygga en DNA-skulptur av kundvagnar. Något för KTH (som har måttot Vetenskap och konst)?

2004-05-13

Alger ger ledtrådar till blodet

I början av förra århundradet lyckades människors blod grupperas med ett system som fick namnet AB0, därmed löstes gåtan om varför vissa blodtransfusioner gick alldeles utmärkt medan andra resulterade i katastrof. Men AB0-systemet räckte inte hela vägen, ett system som först beskrevs hos rhesusapan upptäcktes också gälla i människa och fick därmed namnet Rh. Frånvaro eller närvaro av det viktigaste av Rh-antigenen är det som vi betecknar med ett plus eller minus efter AB0-antigenen. Själv är jag en 0+.

Funktionen hos alla dessa proteiner har inte varit lätt att utreda. Dessutom det är inte bara rhesusapans blod som delar Rh-antigen med oss. Faktum är att det finns Rh-liknande strukturer i flera olika vävnader och till och med hos många encelliga organismer. I kommande nummer av PNAS skriver tre israeliska forskare om de senaste rönen, mest baserade på forskning på en grön alg som heter Chlamydomonas reinhardtii. Slutsatsen de drar är att Rh är en transportmolekyl för koldioxid.

Rött blod har jag sett ganska mycket av, blått har jag hört talas om. Men grönt...?


Artiklen har DOI 10.1073/pnas.0402527101 .

Vetenskap och media

Gustav Holmberg skriver om Aggregerade forskningsnyheter, forskningspolitik och Den mediala vetenskapen. Frågan han ställer sig är hur media bevakar och granskar forskningen. Tar journalisterna bara universitetens pressmeddelanden och nöjer sig med det?

Träffade DN:s redaktör för vetenskap, Karin Bojs, för två år sen och pratade en del om forskning i media. Hon verkade se det som sin uppgift att inte bara ta det forskarna säger och skriva om det utan att också vara granskande.

Gustav tipsar också om två möjligheter att diskutera detta, på i Göteborg den 13 maj och ett ett seminarium på idé- och lärdomshistoria i Uppsala kring boken Den mediala vetenskapen.

Dechiffrera USA:s censurerade dokument

Claire Whelan, doktorand på Dublin City University, lyckades snabbt dechiffrera ett dokument som amerikanska försvarsdepartementet censurerat. Hennes handledare David Naccache kom på idén när han tittade på TV.

"I was bored, and I was looking for challenges for Claire to solve. She's a wild problem solver, so I thought that with this one I'd get peace for a week," Naccache says.

De censurerade orden var bara överstrukna. Genom att veta typsnittet och dess storlek så kunde Claire m.h.a. en ordlista söka igenom vilka ord som passade i det överstrukna området. Sen gjorde de en grammatikkoll för att sålla bort ännu fler ord.

T.ex. så fick hon fram de möjliga orden Ugandan, Ukrainian, Egyptian, uninvited, incursive, indebted och unofficial till meningen nedan.

"An Egyptian Islamic Jihad (EIJ) operative told an XXXXXXXX service at the same time that Bin Ladin was planning to exploit the operative's access to the US to mount a terrorist strike."

Underrättelsetjänsterna i USA sägs fundera på att ändra sättet de censurerar dokument.

2004-05-11

Svenska forskningsnyheter på engelska

Ta en titt på Swedish research news. Swedish contributions to the advancement of science. A blog with newsfeeds. Där får du nyheter om svensk forskning (syndikerat om du vill).

Förnämligt fixat av Stefan Geens

Nu med kommentarer

Man kan nu skriva kommentarer på Explikation! Sätt igång...

Spola bara av med vatten så är operationsbänken steril

På vetenskapsradion pratade de idag om självrenande ytor. En färg som ger sterila ytor bara genom att tvätta dem med vatten skulle spara många utsläpps-liter av bakteriedödande medel. Man testar just nu flera olika ideer för att åstadkomma sådana färger, t.ex. färger som långsamt läcker klor. En annan metod skulle vara att blandai titanoxid i färgen, när ytan träffas av UV-ljus så bildas joner som bryter ner biologiskt material.

2004-05-10

Att vara eller inte vara elektronisk

Alla som är intresserade av hur internetpublicering och open access kan förändra forskningen hoppas jag följer den debatt som pågår på Natures hemsida.

Berglin avhandlar också elektronikens framsteg, men ur ett mer vardagsnära perspektiv.

2004-05-07

Skräp-DNA inte bara skräp.

Hittills så har man trott att de 97% av ditt DNA som inte verkar vara gener bara är skräp. Att det är gammal DNA-kod som inte används för att den t.ex. blivit skadad eller man helt enkelt inte behöver den. Under de sista åren så har man börjat ifrågasätta den synen, fler och fler bevis dyker upp för att skräp-DNA:t faktiskt har funktioner. T.ex. så är det så att stora bitar av det faktiskt transkriberas till RNA precis som generna.

Här är ett annat fynd, det finns delar av skräp-DNA som är ultrakonservativt. De bitarna av DNA ser precis likadana ut i människa, mus och råtta. Regioner som liknar dem finns också hos fiskar, kyckling och hund. Vad de här bitarna av DNA gör som är så viktigt att de måste se likadant ut hela tiden vet man inte riktigt men ett förslag är att det styr andra gener i t.ex. embryots utveckling.

Nature

2004-05-06

Designade barn

Vid Reproductive Genetics Institute i Chicago har fem barn avlats med en teknik som heter Preimplantation Genetic Diagnosis (PGD), skriver New Scientist. Metoden går ut på att ett antal ägg befruktas och analyseras genetiskt innan 2-3 av dem implanteras i livmodern.

Denna teknik har använts flera år för att försäkra sig om att barnet inte ska födas med en oönskad specifik genetisk sjukdom. Det speciella med de här fem barnen är att de istället valdes för att de hade önskade genetiska uppsättningar, så kallade Designer Babies. I samtliga fall hade de en så kallad HLA-profil som gjorde dem till lämpliga stamcellsdonatorer åt syskon med exempelvis leukemi. Men frågan om blivande föräldrar ska få välja vilka genetiska karaktärsdrag deras barn ska ha är kontroversiell och omdebatterad.

I Sverige är denna metod endast tillåten mot direkt dödliga genetiska defekter.

Oetiska ägg?

I februari blev den koreanska forskaren Woo Suk Hwang världskändis när Science publicerade hans artikel där han beskrev en lyckad kloning av mänskliga embryonala stamceller. En speciellt uppseendeväckande del av artikeln hade inte direkt att göra med kloningen, utan att de hade haft tillgång till många gånger fler äggdonatorer än vad som vanligtvis är möjligt. Sexton kvinnor hade ställt upp helt frivilligt utan att få någon ersättning, totalt användes 242 ägg. Varje kvinna gick igenom en obehaglig och riskabel hormonbehandling för att kunna genomföra donationen.

Nu har det börjat dyka upp frågor, främst från människorättsorganisationer, om varifrån äggen egentligen kom. Många anser det vara alltför osannolikt att forskarna ska ha haft tillgång till så många kvinnor som ställt upp utan någon slags påtryckning. Mer vatten på kvarnen fick de när Nature intervjuade en av medförfattarna till artikeln, en kvinnlig forskarstuderande, som påstod att hon var en av donatorerna. Senare tog hon tillbaka detta påstående och hävdade att det var ett missförstånd.

Senaste numret av Nature diskuterar frågan ingående.

2004-05-05

Universalvirus

Oberoende av om du räknar dig som en eukaryot livsform, prokaryot livsform eller som en arké så finns det säkert en sak som irriterar dig. De där protein- och nukleinsyraklumparna som inte ens har egen metabolism, virusen.

Frågan om varifrån virus egentligen kommer har inte varit lätt att besvara. Virus muterar väldigt snabbt (jämfört med alla oss andra, alltså) så genetiska analyser har inte kunnat ge mycket fylogenetisk information, skillnaderna är för stora även mellan virus som säkert har ett ganska nära släktskap.

Ett virus som till vardags tycker om att infektera arkéer i Yellowstone National Park i USA har nu undersökts lite närmre av en grupp forskare. Som väntat visade den inga genetiska likheter med något annat som inte lever, men när de tittade på strukturen för ytproteinerna blev det mycket mer intressant. De såg att det fanns slående likheter med både de virus som infekterar eukaryota celler och de som infekterar prokaryota. Detta betyder att virus troligtvis bildades innan livet delades i de tre ovannämnda delarna.

Artikel heter "The structure of a thermophilic archaeal virus shows a double-stranded DNA viral capsid type that spans all domains of life" av Rice et al och kommer att publiceras i PNAS.


Fotnot för den som är osäker: Om du kan läsa det här är du troligtvis eukaryot.

2004-05-04

Så här i vårtider.

Forskarnas nemesis sol och värme har dykt upp igen. Man lunchar och fikar på balkongen, blir det något gjort på eftermiddagen?

I'm sure the search for knowledge can wait a few more minutes.


Piled Higher and Deeper

Mät ljusets hastighet med marshmallows

Den lille hemmaforskaren bör genast köpa sig ett paket marshmallows och rusa hem/till lunchrummet och mäta ljusets hastighet.

Finding the Speed of Light with marshmallows

Genom GeekPress

2004-05-03

Nya sätt att inte få anslag

Systemet för att tilldela resurser till högskoleutbildningar ska ses över. Enligt Tomas Östros har det existerande systemet lett till en alltför stor likriktning av utbudet av utbildningar, därför ska utredaren bland annat undersöka möjligheten att uppmuntra profilering och arbetsfördelning mellan lärosäten. Senast mars 2005 ska det vara färdigutrett.

Allt detta enligt Linköpings universitet.